Deniz Kuvvetleri Komutanlığı ve Sahil Güvenlik Komutanlığı ihtiyaçlarına göre muvazzaf subay yetiştirmek amacıyla; lisans derecesinde eğitim ve öğretimi akademik olarak planlamak, uygulamak, kontrol/takip etmek, geliştirmek, koordine etmek, desteklemek ve emrindeki teşkilatın bu amaçlar doğrultusunda etkin ve verimli şekilde yönetilmesini sağlamaktır. Deniz Eğitim Bilimleri Enstitüsü'nü eğitim ve öğretim yönüyle desteklemektir.
Geleceğin üstün nitelikli deniz subaylarını yetiştiren, ulusal ve uluslararası yüksek öğretim standartları ile akreditasyon gerekliliklerini azami düzeyde karşılayan dünyanın en iyi askerî lisans eğitimini vermektir.